Disponibilidad e interoperabilidad de datos biológicos y lenguajes controlados a través de la Red RENATA

Descripción del proyecto

Con el presente proyecto, la Universidad Nacional de Colombia, la Universidad Distrital Francisco José de Caldas dos de los más importantes curadores y gestores de información biológica del país, trabajarán juntos en el propósito de liberar dicha información a través de internet.

Categoría RENATA: Recursos de consulta y publicación

Se sistematizarán 75.200 especímenes de plantas e insectos y se obtendrán imágenes digitales de 48.300 especímenes, incluyendo tipos, especies amenazadas, especies forestales y maderables. Toda esta información será puesta a disposición mediante la validación contra lenguajes controlados, para hacerla disponible a través de redes digitales de intercambio de información nacionales e internacionales. El proyecto se desarrollará en 15 meses y tiene un costo de 386.300.000, de los cuales se solicitan 150.000.000 a Colciencias.

Entidades participantes

  • Universidad Distrital “Francisco José de Caldas” (Bogotá D.C.): Rocio del Pilar Cortés Ballén

  • Instituto de Ciencias Naturales-Universidad Nacional de Colombia (Bogotá D.C.): Jaime Aguirre

Duración (meses): 15
Fecha de inicio: diciembre 2007




RENATA facilitando el Intercambio de información geográfica y ambiental de Colombia espacialmente distribuida para el apoyo a la Investigación y el desarrollo local y regional

Descripción del proyecto

La cobertura boscosa en una región, es uno de los indicadores más importantes sobre el estado de los recursos naturales por los innumerables servicios ambientales que los bosques nos brindan.

Categoría RENATA: Acceso a recursos remotos

El uso de la información espacialmente distribuida se ha convertido en una de las herramientas más poderosas para el apoyo a la investigación y el desarrollo de cualquier pueblo o región.

Igualmente, las herramientas de Sistemas de Información Geográfica (SIG) como de teledetección se distinguen por ser la clave para el uso de la información espacial. Estas herramientas día a día están más al alcance de la comunidad bien sea con software licenciado o libre, pero definitivamente, el acceso a la información espacial actualizada y con propiedades estandarizadas sigue siendo una limitante en todos los proyectos de investigación ambiental y desarrollo.

El uso de RENATA como herramienta de gestión e investigación de los recursos naturales se encuentra en sus albores. Sin embargo, con relación al manejo de información espacial, tan solo existe la experiencia reciente de la Red RUTA: Estudio de la biodiversidad del Caribe colombiano para diseño de estrategias de uso sustentable y su conservación.

El presente proyecto une a dos instituciones de educación superior de diferentes departamentos (Valle del Cauca con RUAV y Boyacá con UNIRED), con el objeto de desarrollar una metodología que ponga al alcance de la comunidad científica e investigativa información espacial tanto en formato vector como raster de diferente temática a nivel nacional, usando herramientas de manejo de datos espaciales en Web como WMS, WFS, WCS y WPS, aplicando estas herramientas en RENATA, para identificar sus beneficios en la transmisión de grandes volúmenes de datos espaciales requeridos en el apoyo de la investigación ambiental y los proyectos de desarrollo.

El propósito de enlace entre las instituciones a través de RENATA es compartir-ofrecer-disponer información espacial (en formato de lectura de alguna herramienta de SIG) y al Instituto Geográfico Agustín Codazzi (IGAC), bien sea vector o raster y (que usualmente son pesadas por su gran tamaño dependiendo del área y el detalle presente en ella), para ser usada en investigación, análisis y desarrollo de las áreas a que se refiere esta información. Dichos datos-información podrán ser usados por medio de aplicaciones específicas diseñadas para tal propósito utilizando los diferentes recursos de manejo de información espacial en Web (como WMS, WFS, WCS y WPS) según lo requiera la metodología, el modelo de simulación incluido en la aplicación y los resultados esperados del proceso. Estas aplicaciones serán muy puntuales para el caso de este proyecto, las cuales involucren consulta, relaciones espaciales topológicas y de sobre-posición, operaciones matemáticas y estadísticas, entre otros.

Una de las bondades del proyecto es ofrecer información espacial como la cobertura boscosa, cuerpos de agua, vías, centros poblados, curvas de nivel, límites municipales, e información ambiental entre otros, de uso para propósitos definidos, dado que la propiedad y potestad de la información es una variable de peso en el uso y disposición de la información; la diferencia que se espera lograr es la forma de acceso a ella, dado que no se pretende que los usuarios de la información no requieran descargar la información (por sus grandes volúmenes y sus restricciones de acceso), sino que por el contrario, accedan a los datos directamente a la fuente por medio de una aplicación especifica diseñada para un propósito definido (puede ser un modelo de simulación) lo operen, analicen y generen los resultados esperados directamente en línea. La aplicación debe contar con la posibilidad de relacionar información de diferentes fuentes y lugares, al igual de ofrecer la posibilidad de relacionarla con información propia dentro del modelo, y generar los resultados en forma local.

Con esta estrategia se busca la posibilidad de ofrecer información y aplicativos espaciales a quienes no disponen nada de ellos, ni requieren tener ni los datos ni los aplicativos para generar sus propios resultados. De la misma forma, se está conservando la potestad en el manejo de la información y de los aplicativos, porque ninguno de los dos son descargados sino operados remotamente, y generará resultados para cualquier parte del mundo.

Para la prueba de esta iniciativa, cada una de las universidades involucradas dispondrán cierta información geo-espacial en línea de áreas geográficas de su propio interés (Zona Andina y del Sur Occidente del País) al igual que el IGAC-CIAF servirá de apoyo con información especializada para cada caso del ejercicio. Las universidades involucradas diseñarán los aplicativos de consulta, procesamiento y análisis para producir sus resultados en línea. Los resultados y aplicativos estarán a disposición de la comunidad por medio de los portales que se construyan específicamente para el manejo de esta información.

La investigación generará resultados relacionados como: 1- la valoración de las funcionalidades de RENATA en el manejo de datos espaciales en general y en particular sobre cobertura boscosa y herramientas de modelación ambiental, 2- comparación de eficiencia de RENATA con el tratamiento de los datos sobre la conexión normal de Internet (para quienes no lograron conectarse en las condiciones de RENATA), 3- poner a disposición información y tecnología a quienes no cuentan de ellas, 4- romper paradigmas en el uso de información espacial sin ser experto o poseer las herramientas que aun hoy día mantienen un circulo pequeño de usuarios, 5- portal permanente de enlace y procesamiento disponible para toda la comunidad, 6- publicaciones y divulgación del proceso, los resultados y la metodología adoptada.

La metodología involucra cuatro etapas: 1- formalización de acuerdos y condiciones en el manejo de la información estándar, 2- definición de los aplicativos, sus requerimientos y alcances a diseñar-construir para el proyecto, 3- Implementación de herramientas de informática, bases de datos y portales de manejo del proyecto, y 4- documentación, divulgación y consolidación de resultados.

Los resultados esperados son: 1- Portal de acceso y manejo del proyecto operado en RENATA, 2- Aplicativos de manejo de los datos según sea diseñado dentro del proceso por cada Universidad, 3- Bases de datos distribuidas de información espacial en cada institución involucrada en el proyecto, 4- Dos publicaciones en revistas indexadas, 5- Dos tesis de pregrado y una de Maestría con recurso humano formado en el tema con la formación básica de los estudiantes en sus actividades dentro de los grupos de investigación como semilleros de investigadores, y 6- Documentación e informes.

Instituciones participantes

  • Universidad del Valle

  • Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia – UPTC

Duración (meses): 18
Fecha de inicio: enero 2010




RENATA aplicada en la generación de soluciones de información ambiental, coberturas vegetales y cambio de uso del suelo para Colombia, accediendo a bases de datos espaciales distribuidas y su manejo con aplicativos remotos

Descripción del proyecto

El Grupo de Investigación en Simulación y Modelación Dinámica Espacial (GISMODEL) de la Universidad del Valle fue creado básicamente para trabajar en la aplicación de técnicas de modelación dinámica espacial con datos de de Sistemas de Información Geográfica (SIG) y sensores remotos (SR) en Web y consiguiente para explorar los beneficios de RENATA para este campo.

Categoría RENATA: Recursos de citación y publicación

El grupo cuenta con investigadores locales y extranjeros, con quienes desde sus instituciones dan apoyo al grupo y a sus iniciativas; de esta forma, los investigadores del grupo al pertenecer a diferentes instituciones y sitios geográficos a nivel global, hacen que estratégicamente al interior del grupo se puedan coordinar actividades de manejo de información en forma remota. Por tal razón, la importancia de involucrar a RENATA como parte de los medios que dispone el grupo para adelantar sus actividades, hace que la presente convocatoria se convierta en una oportunidad direccionada a los objetivos del grupo.

El proyecto propuesto abordará una problemática asociada al medio ambiente, hábitat y recursos naturales, para aportar en dirección de su solución con tecnología de informática. La problemática identificada es la dificultad de acceso que tiene la comunidad científica tanto a la información ambiental espacial como a los aplicativos o modelos que usan esa información, para identificar espacialmente eventos, causas o consecuencias de ciertas dinámicas que afectan a los recursos naturales, la comunidad o la misma sostenibilidad de la humanidad. Todo esto se fundamenta en la generación de información espacial útil en la toma de decisiones, ofreciéndola directamente al investigador o al productor.

La información que se dispondrá en el proyecto a través de un aplicativo de consulta en Web es: imágenes de sensores remotos MODIS y GOES para presentar la deforestación y el cambio de uso del suelo; herramientas de aplicativos espaciales de modelos ambientales y de producción con base en variables climáticas como precipitación, temperatura, humedad del suelo, radiación solar, entre otros, todos con evaluación temporal de acuerdo a la periodicidad de los datos del sensor. La información ofrecida también será de mucha utilidad para productores y agricultores en el seguimiento de las variables ambientales aplicado a diferentes escalas espaciales y temporales.

Aprovechando los avances tecnológicos e informáticos, el servicio de procesos de información espacial a través de la Web, se vislumbra como una alternativa innovadora de manejo de datos, colocando al servicio de los usuarios tanto información especializada como también aplicativos de SIG, sin que el usuario tenga residente en su sistema personal ni la información ni los aplicativos especializados. De esta forma, los Servidores de Procesos en Web (WPS) desarrollados por Open Geo-spatial Consorcium (OGC) en software libre posibilita construir herramientas que hasta hoy han sido potestad de los SIG, para ser dispuestas en aplicativos de consulta, manejo y edición en Web.

La metodología propuesta para alcanzar los objetivos se presenta por etapas:

Etapa I – Formalización de acuerdos Inter-institucionales, los cuales generarán un vinculo y compromiso de los aportes como información claramente definida y aplicativos existentes.

Etapa II – Adecuación de la información espacial y generación de las estructuras para disponerlas accesibles en RENATA.

Etapa III – Desarrollo de aplicativos de consulta y portal para RENATA y Web para disponer el acceso de los productos a la comunidad, y Etapa IV – Actividades de divulgación, documentación y valoración del ejercicio a la luz de RENATA y la comunidad científica; esto último involucra generación de informes, participación en conferencias, formalización del conocimiento a través de una publicación científica y la misma disposición del producto del proyecto a través del portal de Internet a toda la comunidad científica y de los diferentes sectores.

El producto del proyecto será un portal con aplicativos de consulta que ofrezca la información procesada ya mencionada para la cobertura geográfica de Colombia. Igualmente se producirá una documentación tanto de memoria del ejercicio como informes, ponencias y artículo de publicación, como también una evaluación del proceso, del papel de RENATA en el proyecto con sus estadísticas comparativas, y finalmente la promoción del sitio para su consulta.

Los paradigmas que enfrenta el proyecto son: 1- Evaluar la eficiencia de RENATA en la transmisión de grandes volúmenes de datos espaciales (datos de Sistemas de Información Geográfica y sensores remotos), 2- Integración de RENATA en el mismo tráfico mencionado con redes de Europa (King’s Collage London, en el Reino Unido), comparado con las conexiones locales (CIAT-Palmira), 3- Implementación y desarrollo de una nueva tecnología (servidor de procesos en Web con datos espaciales), que accedan bases de datos a través de aplicativos, sin descargar la información, 4- Poner en manos de expertos información ambiental y herramientas para su manejo y análisis con propiedades de SIG, sin que el usuario deba tener ninguna de ellas en su sistema personal. 5- Jovenes investigadores que han desarrollados sus tesis de pregrado en apoyo al proyecto desde la figura de semilleros de investigadores.

Instituciones participantes

  • Universidad del Valle

  • King’s College London

  • Centro Internacional de Agricultura Tropical

Duración (meses): 18
Fecha de inicio: enero 2010




Integración de datos biológicos y culturales para la difusión en línea del conocimiento sobre las plantas de Colombia

Descripción del proyecto

Una de las necesidades más apremiantes para apoyar la conservación y uso sostenible de la alta biodiversidad que posee Colombia es contar con información de alta calidad sobre los recursos bióticos, que esté disponible a un amplio nivel de público.

Categoría RENATA: Recursos de citación y publicación

Dentro de este contexto, el presente proyecto tiene como objetivo la creación de un poderoso recurso integrado para la divulgación en línea de datos biológicos y culturales de la Universidad Nacional de Colombia a través de la red de alta velocidad de RENATA.

Esta RED apoyará los procesos de investigación, educación y desarrollo del país, a la vez que fortalecerá nuestra capacidad de cooperación interinstitucional. Para esto se completará, sintetizará y consolidará la información del Diccionario de las Plantas de Colombia; se depurará y consolidarán las bases de registros botánicos existentes en el herbario MEDEL (Universidad Nacional de Colombia, sede Medellín), y se generará enlaces interaplicativos entre la colección virtual del Herbario Nacional Colombiano (COL), el más grande del país, con las colecciones del Herbario MEDEL y con el Diccionario de las plantas de Colombia.

De esta forma, tanto la información científica, como la información cultural de las plantas de Colombia estarán accesibles no sólo a la comunidad académica sino también al gran público a través de la red Renata, de tal forma que se constituya en una herramienta educativa.

El proyecto, presentado por el Grupo de Investigación en Sistemática y Evolución de Gimnospermas y Angiospermas Neotropicales (SEGAN), tendrá una duración de 15 meses y contempla la participación de dos Redes Académicas Regionales, integrantes de la red RENATA: la red RUMBO, de Bogotá (representada por el Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional, Sede Bogotá) y la Red RUANA, de Antioquia (representada por la Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín).

El presupuesto total del proyecto es de $153.800.000, de los cuales se solicitan a COLCIENCIAS $ 100.000.000, y la contrapartida es de $ 53.800.000, de los cuales $ 45.100.000 corresponden a la contrapartida de la Universidad Nacional, sede Bogotá (RED RUMBO), y $ 8.700.000 a la contrapartida de la Universidad Nacional, sede Medellín (RED RUANA). La Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá, será la entidad encargada de representar el proyecto y administrar los recursos.

Instituciones participantes

  • Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá

  • Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín

Duración (meses): 15
Fecha de inicio: enero 2010




Aplicativo Web sobre insectos y sus enemigos en Colombia: Wikinsecta

Descripción del proyecto

De acuerdo con los delineamientos de la Convocatoria de Colciencias 487-09, se planea el desarrollo tecnológico de un aplicativo innovador, que hará uso de la infraestructura y servicios de RENATA (Red Nacional Académica de Tecnología Avanzada). Este aplicativo y la información que se introduzca, quedará al servicio de la comunidad académica y científica de Colombia, pudiendo interactuar con la comunidad internacional y centros de investigación de otras partes del mundo.

Categoría RENATA: Recursos de citación y publicación

La propuesta será ejecutada en unión de dos Instituciones, una de investigación: Cenicafé y otra de educación: Universidad Nacional sede Medellín, que pertenecen a las redes locales RADAR y RUANA, respectivamente. Los grupos de investigación involucrados “Manejo Integrado de Plagas – Disciplina de Entomología” y “Ecología y Sistemática de Insectos” respectivamente, están debidamente avalados por Colciencias.

La idea es desarrollar un aplicativo en el cual se pueda depositar información básica sobre registros de insectos de Colombia, que incluyan insectos plagas de cultivos, insectos registrados en estudios de biodiversidad, insectos de importancia en salud humana y animal y la fauna benéfica que los afecta. Este aplicativo Web se denominará Wikinsecta y estará basado en un software de Wikimedia con licencia de libre uso.

Un alto porcentaje de esta información sobre insectos no está disponible o yace en publicaciones muy antiguas de difícil acceso, o reside en colecciones de insectos en diversos lugares del país.

En el aplicativo que se desarrolle, se podrá incluir no solo la información sobre los registros de los insectos, sino toda la información disponible sobre huéspedes, biología, características morfológicas, distribución y control.

También, aprovechando las características de RENATA, se puede hacer uso de ayudas multimedia para ilustraciones, fotografías, presentaciones, seminarios, videos, y conformar grupos de discusión sobre temas de actualidad. A toda esta información tendrá acceso libremente la comunidad de académicos, estudiantes e investigadores de Universidades y Centros de Investigación en Colombia.

El contenido inicial del aplicativo lo ingresa personas conocedoras del tema bajo la supervisión y revisión de un editor general, quien tiene un amplio conocimiento en Entomología y de las fuentes de datos que servirán para alimentar el sistema.

El aplicativo, como se dijo anteriormente, será de libre acceso y uso una vez se entregue con la información inicial propuesta, para que cualquier investigador o académico registrado, introduzca información pertinente a los objetivos propuestos, previo el visto bueno de un webmaster. Es un desarrollo a semejanza de Wikipedia.

Este proyecto encaja perfectamente en las políticas del gobierno colombiano de impulsar el desarrollo de las Tecnologías de Información y Comunicaciones (TIC) y beneficiará a todos los investigadores y profesores de la Entomología que contarán con la información pertinente para sus labores en una forma integral y expedita. Esta información será también de gran utilidad para otros funcionarios encargados de preservar la Sanidad Vegetal del país. La utilización de Wikinsecta será a través de Renata y podrá expandirse sin límites a través de la apropiación y colaboración de la comunidad académica y de investigadores de Colombia.

Instituciones participantes

  • FNC -Centro Nacional de Investigaciones de Café, Cenicafé

  • Universidad Nacional sede Medellín

Duración (meses): 15
Fecha de inicio: enero 2010




Difusión de datos biológicos en la red como apoyo a la educación ambiental, investigación científica y conservación de la biodiversidad en Colombia

Descripción del proyecto

Las colecciones biológicas son depositarias del patrimonio biológico de una nación, en ellas se almacenan ejemplares para su estudio y en muchos casos como únicos testigos de especies ya extintas.

Categoría RENATA: recursos de consulta y publicación

En países megadiversos como Colombia, dichas colecciones adquieren una importancia extrema en procesos investigativos y educativos que conciernen no solo a nuestro país sino también al mundo entero. Sin embargo, no siempre es fácil acceder a esta información por falta de recursos y/o tiempo para extraerla directamente de las etiquetas de colecta o catálogos de los especímenes.

No solamente la comunidad científica y los actores responsables de la toma de decisiones en los temas referentes al medio ambiente tienen un interés por conocer la información sobre nuestra diversidad, sino que la comunidad en general puede y debe interesarse por conocer nuestros recursos naturales, para ello se hace necesario establecer un puente de comunicación entre la comunidad científica y el ciudadano común, que generalmente no comprende los términos y las especificaciones de estas colecciones.

En la actualidad, las colecciones biológicas del ICN contienen más de 800.000 especímenes, lo que hace de ellas las colecciones más representativas de la fauna y flora a nivel nacional e internacional de Colombia. La colección herpetológica de la UIS almacena cerca de 6.000 especímenes de reptiles y anfibios lo que la convierte a esta colección en la más representativa del nororiente colombiano en dichos grupos.

Al final de este proyecto se entregarán 13.800 nuevos registros biológicos de las colecciones zoológicas del ICN y la UIS. Estos registros entraran a fortalecer los casi 400.000 registros biológicos que el ICN hace disponibles en su portal de colecciones virtuales www.biovirtual.unal.edu.co. Además se entregará una aplicación web de Educación Ambiental que permitirá tener un conocimiento general de las características que diferencian los principales grupos de reptiles presentes en Colombia y información muy importante de esta biota de una manera divertida e interactiva.

Entidades participantes

Nombre de la entidad  Rol
Instituto de Ciencias Naturales. Facultad de Ciencias. Universidad Nacional de Colombia – Sede Bogotá, (ICN)  Ejecutora
 Universidad Industrial de Santander (UIS)  Participante
 Idrocolectivo (IDRO)  Participante

Duración: 10 meses
Fecha de inicio: agosto 2010
Servicio estrategia e-ciencia: Recursos de consulta y publicación
Áreas participantes: Cultura y ambiente, Ciencias básicas, Educación, Electrónica, telecomunicaciones e informática
Convocatoria: 2010